畜牧業作為國民經濟的重要組成部分，改革開放近四十年來，其隨著國民經濟的發展在逐漸占據了城市居民口糧的主要地位。特別是近幾年，隨著居民對肉、蛋、奶等畜產品消費需求品質的不斷提升，畜牧業這幾年的發展也始終被“食品安全”所聚焦。
但是，由于其居民生活提高帶來的對肉、蛋、奶等畜產品的硬性消費增長，其在國民經濟發展中所占的比重在逐漸加大，在扮演著支柱產業的角色。可是，這幾年畜產品安全事件增多，動物疫情形勢依然比較復雜，飼料價格趨漲、原料來源壓力加大，以及環境約束趨緊，使得畜牧業面臨巨大的發展挑戰，所以國內的畜牧業必須通過轉型升級，來適應新的發展形勢要求。看當前畜牧業的發展現狀與行業公布的數據，國內畜牧業的發展轉型還處于摸索期，這一過程還應尊重規律、循序漸進地展開。我國幅員遼闊，從北到南，從東到西，各地畜牧業的自然條件、經濟基礎、發展階段都存在差異，在選擇轉型方向時應當辯證地分析再決策。首先，畜牧業的傳統模式與現代模式，要有選擇的辯證分析。傳統畜牧業是簡單地利用畜禽生產機能的初級模式，而現代畜牧業是充分掌握自然規律，采取科學技術和管理措施，有效地促進畜禽生長發育的高級模式。事物的初級形式向高級形式躍遷，這是事物發展的基本規律，但需要一定的過程。傳統模式還有生長的土壤——我國還有大量農民將傳統養殖作為家庭主營產業，不具備立刻轉型的條件;畜產品消費市場不斷細分，使得傳統養殖產品越發受到青睞。
因此，選擇現代化的畜牧生產模式將會是歷史的必然，但就現階段而言不可能一蹴而就。其次，國內畜牧業發展與環境保護之間的矛盾，需要辯證分析。對于國內養殖業的污染問題，現已成為阻礙畜牧業持續健康發展的主要問題。為減少污染，各地多采用關停的方式、減排的方式來控制養殖量，使得畜牧生產與環境保護間形成尖銳的矛盾。但事實上，保護生態與發展畜牧業，從長期看是利益一致，相互促進的。利用畜牧業過腹還田的功能，既能減少大氣污染又能加快生態有機農業發展;利用畜禽排泄物中貯存的生物質能，既解決了養殖能耗問題又推動了農業可持續發展。也就是說，如能將畜牧業自身的發展和生態經濟有機結合，就能實現兩者共贏。
最后，對于那種由原掠奪型向生態型發展的轉型趨勢，也需要辯證分析。那些掠奪型的養殖模式，是用人工干預手段，強行改變動物生活習性，以高資源投入為代價換取動物快速生長。不論從生態文明、畜產品安全還是動物福利角度看，這種工廠化、掠奪型的養殖模式越來越受到詬病，發展生態畜牧業已成為共識。但從各地的實踐看，生態型畜牧業多停留在理念、理論階段，實際生產經營中鮮有成功案例，這與生態型畜牧業投資周期長、見效慢、消費群體尚在成長等因素有關。因此，不切合資本實際和市場實際地盲目擴大發展生態畜牧產業，只能造成項目爛尾和資金浪費。應以市場為導向，生態資源為依托，投入資金良性運轉為基礎，逐步擴大發展生態型養殖模式，在探索中挖掘生態效益。
