有的農戶用病豬住過的豬圈再養豬，結果豬再次發病，甚至死亡，損失嚴重。為此，必須將圈舍消毒后再養豬。消毒方法如下：
1.豬舍消毒。先將圈舍清掃干凈，再用20%的石灰乳或3%的熱燒堿水、20%的漂白粉進行消毒。消毒的次序為墻壁、圈欄、門窗、食槽、地面、用具及門口地面。消毒藥水可用掃帚涂刷;最好用噴霧器噴灑。消毒完畢，豬圈設有門窗的應關閉2至3小時再打開，同時將食槽及地面用清水沖洗干凈。
2.土壤消毒。泥土地面應先消除糞便、墊草等污物，然后再將上面的一層泥土鏟除，最后用20%的漂白粉或20%的石灰乳、3%熱燒堿水澆灑。
3.糞便及污水消毒。少量的糞便、墊草等可以深埋。糞便的數量如果較多，可用發酵法來消毒。方法是：在離豬舍稍遠的地方，在地面挖一淺溝，深約40厘米，寬約2米，長度視糞便多少而定。底部先鋪健康豬糞一層，然后將病豬糞堆上，在病豬糞上邊再蓋一層健康豬糞及雜草，最后用稀泥密封。病豬糞很稀時，可添加干土或干碎草，太干時可加入適量水，使其迅速發酵。夏秋約1個月，冬春約2個月，即可達到消毒的目的。
病豬舍的污水，數量較少時可澆在糞便內一起發酵消毒;數量很多時可在污水總量中加入2%的生石灰粉或0.2%的漂白粉進行消毒。
