3月下旬，農業部網站發布《重點流域農業面源污染綜合治理示范工程建設規劃(2016-2020年)》，對未來四年內農業污染治理工程建設提供了具體參考依據，其中對養豬業也有多處涉及。
目標：示范區畜禽污染綜合利用率達到90%以上
《規劃》指出，我國農業面源污染主要來源有：一是畜禽水產養殖。每年畜禽糞污產生量約38億噸，綜合利用率不到60%。水產養殖過程中大量餌料、養殖用藥的使用，造成集中養殖區域水環境污染。二是化肥;三是農藥;四是農作物秸稈;五是廢舊地膜。
《規劃》還指出，近年來畜禽水產養殖污染防治取得明顯進展。印發了《促進南方水王地區生豬養殖布局調整優化指導意見》，科學劃定禁養區，優化養殖布局。組織實施畜禽標準化養殖項目和畜禽糞污資源化利用試點，開展畜禽標準化示范創建。推進農村沼氣轉型升級，建設規模化大型沼氣工程386個，規模化生物天然氣工程試點25個，新增沼氣生產能力4.87億立方米，處理利用畜禽鮮糞等農業有機廢棄物950萬噸。
《規劃》提出了具體的工作目標，到2020年，建成一批重點流域和區域農業面源污染綜合防治示范區，探索形成一批可復制、可推廣的技術與模式，為全面實施農業面源污染治理提供示范樣板和經驗。示范區化肥村域混合污水及畜禽污染綜合利用率達到90%以上。
重點：這10大區域要重點治理
治理區域
依據《農業環境突出問題治理總體規劃》，在洞庭湖、鄱陽湖、太湖、海河流域、松花江、淮河、三峽庫區、丹江口庫區、巢湖、洱海等重要水源保護區和環境綜合治理。小流域要求具有明確的分水嶺或匯水、排水邊界，流域內農田規模不小于2萬畝，糞污產生量不小于2萬頭生豬當量。
重點工程
根據流域農業面源污染組成特征，因地制宜建設農田面源污染綜合防控、畜禽養殖污染處理、水產養殖污染防治、農業廢棄物循環利用等工程，治理農業面源污染。
在示范區所在的縣科學劃定禁養區，根據縣域資源環境承載能力，合理確定養殖規模，以地定養，以養促種，加快畜牧業生產方式轉變，推進種養結合和生態養殖模式。科學配置飼料，規范飼料添加劑使用，提高飼料利用率，減少氮、磷等排放。在重點流域，價錢糞污處理設施建設，推進畜禽廢棄物的無害化處理和利用。
畜禽養殖糞污處理工程——對于規模化養殖場，因地制宜采用污水減量、厭氧發酵、糞便堆肥等技術，按照三改兩分再利用、中央一體化等模式處理畜禽污染，主要建設內容包括前處理設施、厭氧消化設施、生物燃氣利用設施、厭氧消化剩余物利用設施等。對于分散畜禽養殖密集區，可結合畜禽糞便收集站建設，因地制宜建設糞污處理中心，主要建設內容包括堆肥設施、污水高效處理設施、污水轉運設施等。對于位于禁養區內、必須拆除的規模畜禽養殖場，對其異地重建及建設配套糞污處理設施予以補助。
畜禽養殖廢水農田消納工程——針對無害化處理后的樣子廢水中富含的氮、磷、有機質等營養成分，因地制宜建設以處理后養殖廢水貯存池為核心的養殖廢水農田利用工程，配套灌溉管帶和運輸車輛
思路：治理要多還舊賬、不欠新賬
總體思路
以“一控兩減三基本”為目標，選擇受農業面源污染影響嚴重突出的重要水源區和環境敏感流域，以縣為單位，強化頂層設計，優化調整農業結構和布局，堅持源頭控制與過程防治相結合、農藝措施與工程措施相結合、重點治理與全面推進相結合、政府引導與多方參與相結合，轉變農業發展方式，恢復農田生態功能，探索高效治理模式，“多還舊賬、不欠新賬”，促進重點流域生態環境逐步改善，推動資源節約型、環境友好型、生態保育性可持續農業發展。
基本原則
1、重點突破統籌推進。立足當前，著力解決對流域水環境保護與農業可持續發展制約性強的突出問題，以地方政府為主體，以縣為基本單位，以農業流域為核心示范區，開展農業面源污染綜合治理工程建設，通過流域治理經驗總結，以點帶面，統籌推進農業面源污染防治。
2、堅持市場政府兩手發力。充分發揮市場在資源配置中的決定性作用、政府在污染治理中的引導作用，堅持政策引導、市場運作、全民參與的方針，調動農民和企業的參與積極性，全方位、全過程推動污染治理。
3、堅持檢測督導有效結合。強化監測預警，加強督導檢查，落實責任主體，推進工作落實，跟蹤實施進度，制定績效評價標準，引入第三方評估，健全評價機制，推動工作督導與績效考核相結合。
